温州市教育教学研究院成立于2004年，其前身是温州市教育局教学研究室（温州市教育科学研究所、温州市职业教育教学研究室）。

主要承担中小学教育理论、政策和实践研究；落实国家课程方案、课程标准和相关教材的实施；指导全市中小学教育教学实践和研究；组织各类学科教研活动和评审；承担全市教育科研规划、立项与管理；组织开展全市中小学教学质量和学生学业评价与管理；组织地方课程教材及配套教学用书编写，编辑教育学术刊物。内设机构有：办公室、高中教学研究室、中职教学研究室、初中教学研究室、小学（学前）教学研究室、综合教学研究室、教育科学（德育）研究室、《温州教育》编辑部、大数据研究中心9个机构。挂靠机构有 :市教科规划办、市教育学会秘书处、市教育学会中小学学科教学分会（共24个）。市教研院拥有一支力量雄厚的教科研队伍，全院共51人，其中教（科）研员43人；高级职称45人，占88%；第一层次教师共26人，占51%，其中特级教师12人，正高级教师（含教授级中高）19人，市名教师6人。

近年来，市教研院深化基础教育课程改革，分三轮推进课堂变革，打造“五育融合”育人新生态，务实担当，积极作为，成效显著。先后被温州市委、市政府授予“全面实施乡村振兴战略突出贡献集体”荣誉称号，被评为“浙江省中小学教学改革项目突出贡献奖”，被教育部评定为“基础教育国家级优秀教学成果推广应用示范区”，被北京师范大学确定为“指向核心素养项目学习”区域整体改革试验区，被人民教育出版社确定为德育研究实验基地，集体研究成果《以“瓯越文化课程群”为载体的课程建设区域推进模式》获国家级教学成果二等奖。